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Il lago di S. Maria è il più fragile del sistema, sia per il suo volume inferiore a quello di Lago, sia a causa del minor ricambio d’acqua che in tempi recenti era affidato alle sole sorgenti sotterranee. Queste sono individuabili d’inverno quando le polle d’acqua sono visibili sul lago ghiacciato dove l’acqua non gela.
Negli ultimi anni queste sorgenti sembrano essersi ostruite, forse anche a causa dell’apporto terroso dei torrentelli che si formano durante il periodo piovoso ed a causa della scomparsa della zona di decantazione.